不愿见到自己的时间，应该是在青紫峰独孤庆天与剑圣秦唯一战，父亲败于一笑剑法之下，恼羞成怒跳下悬崖之后。

以独孤庆天的武功修为，自然不会有大的事情，只不过因为被剑圣秦唯击败，心情大坏，万念俱寂，一心求死，以至落下山崖时，不愿保护自己，从而造成重伤，这个过程的描述是叔叔独孤无寿亲口对自己说的。

幸亏左使韩不破、右使姜尚全带人不惧危险，深入崖底，找到了受伤的独孤教主，并带回傲来山独孤圣教总坛医治。但不知什么原因，父亲的伤一直没能治好，已父亲的内功修为和强健的体魄， 这点伤应该不算什么，不至于拖得日子如此之久，独孤琴苦于不能见到父亲，着实像热锅上的蚂蚁一样。

后来还是见到叔叔独孤无寿才得知，父亲独孤庆天一直拒绝治疗，于是叔叔独孤无寿和左使韩不破及右使姜尚全一起商量办法，最终决定将独孤庆天制服，用天蚕丝捆住，关在密室，然后再找来医生为其诊治。

叔叔独孤无寿为了不让独孤琴看到这种场面，便下令禁止独孤琴来密室探望独孤庆天，独孤琴也没有办法，只好不时向叔叔独孤无寿打听父亲医治的消息。

几个月后的有一天，叔叔独孤无寿告诉独孤琴，父亲独孤庆天的病已经治愈，只是现在性格变得非常乖戾，什么人都不想见，包括独孤琴。独孤琴想去看看究竟，叔叔独孤无寿未允许。只说等到独孤庆天想见的时候，再另行通知。独孤琴只好无奈的走了。自此之后，独孤琴便再也未见到过父亲独孤庆天，有时找叔叔独孤无寿打听消息，独孤无寿的下属回报，叔叔独孤无寿出去办事，还未归来。再后来听说独孤庆天已经开始主持教中事务，便想见即上一面，也未获得准许，在总坛大殿前面让守卫给拦住。

有一次，好不容易碰到叔叔独孤无寿，叔叔依旧说教主还是不见自己的女儿独孤琴，独孤琴听到此话之后，心里难过之极

现在的独孤庆天每次登上庆天殿，都是显得非常神秘，并且在宝座之前与大殿之间隔上厚厚一层珠帘，安排教中事务，都是隔着帘子发号施令，实在是让人猜不透具体原因。