作为南明派出的使团，左懋第一行走的很慢，直到1644年十月初一才抵达了通州张家湾，而早在20多天前，顺治皇帝就已经进入了北京，正式完成了满清迁都的任务，从这一点来看，左懋第的使团就注定完不成他们的使命。
左懋第进京后，志在夺取全中国的清廷已经得知了青州之变，因此根本就无意与左懋第等人谈判，因此以上国态度居高临下的将左懋第一行安排在了四夷馆居住，左懋第为此争辩再三，才好不容易住进了鸿胪寺。
然而，出面接待左懋第等人的清内三院大学士刚林并不想进入正题，便整日以朱由崧继位是不是合法、南明是不是合法政权这件事跟左懋第扯皮；于是，前后二十多天里，一点实质性的内容都没有涉及，无可奈何的左懋第只好悻悻而归。
只是，使团才走出永定门，降清的前明大学士冯诠便劝多尔衮不要“放虎归山”，免得泄漏了燕京虚实；多尔衮接受了冯铨的意见，派百骑追至沧州，将左懋第等人押解回了北京。
随即，左懋第一行被扣留在北京太医院内，墙上遍布荆棘，正门后门角门俱都有守兵。
抱定守节殉国之心的左懋第便自言道：“生为明臣，死为明鬼，我志也。”
为了击退清王朝的利诱劝降，左懋第又写了“生为大明忠臣，死为大明忠鬼”的对联贴在门上，一则明志，一则堵劝降说客之口，此外，左懋第还画了一幅苏武牧羊画像，挂在墙上自我激励······
“先生们，请告诉我，他们是谁？”在左懋第使团被扣、明清和议宣告彻底破裂的消息还没有传回南京的时候，一队炮舰出现在了马尼拉的港外。“他们要干什么？”
对于sabinianomanriquedelara总督的问题，马尼拉港口警备队司令普埃托利亚诺少校报告道：“他们自称是明帝国皇家海军北方舰队，是来向我们传达明帝国皇帝陛下的旨意的。”
马尼拉商会会长奥罗佩萨嘲笑道：“中国皇帝是不是又想来菲律宾挖黄金了！”
“闭嘴，你这个蠢货！”sabinianomanriquedelara总督呵斥道。“现在马尼拉港外停着12艘重型巡航舰，每一艘至少都有24门大炮，足以消灭西班牙在菲律宾全部舰队，把马尼拉化为火海，在这种情况下，我不想听到某些人无脑的发言！”
奥罗佩萨不以为然的说道：“也许中国人的炮舰只是样子货呢！”
“卫兵，把这个蠢货抓起来！”sabinianomanriquedelara总督怒不可恕的下令道。“至少在明帝国舰队离开之前，不要放他出来！”
卫兵领命上前，把奥罗佩萨给抓了起来，奥罗佩萨这才惊慌起来：“阁下，您不能，不能这样对待一名绅士，赶快放了我，否则，我会向新墨西哥控告您的。”
总督一扬下巴，卫兵便把大喊大叫的奥罗佩萨给拖走关押了起来，等奥罗佩萨惊恐的声音从回廊里消失后，总督继续向普埃托利亚诺少校问道：“中国皇帝有什么旨意？”
“中国皇帝从某种渠道获知我们即将对马尼拉及整个菲律宾的中国人展开屠杀，所以，勒令我们不得迫害本地中国居民，但中国皇帝同时表示，舰队会将一部分希望返回中国本土的中国人带走，以减轻本地的治安压力。”
总督想了想，问道：“中国皇帝换人了？”
“是的，”边上一位教会的神父回应道。“根据giulioaleni（艾儒略）神父及杭州等地教会的通报，过去那位中国皇帝在内乱中，被叛军杀死了，现在的中国皇帝是6月登基的，原来是封地在洛阳的一位亲王，也是福尔摩沙岛北部殖民地的主人。”
总督舒了一口气：“原来是这位陛下，看起来，他只是对用金钱赎买菲律宾华人有所不满，而不是真的对菲律宾拥有兴趣。”
神父言道：“我个人也是这样判断的，之前根据中国的法律，亲王是不准拥有自己的军队的，所以，当时的这位皇帝，只能屈辱的用向我们付钱的方式获得必要的人口，但现在，他成为了整个中国的皇帝，自然要拿回过去丢失的脸面