左梦庚之前也试图用督战队阻止士兵逃跑，但后来跑的人越来越多，督战队根本阻止不了，然而被裹挟着一起逃了。
于是，见势不妙的左梦庚，也顾不得通知他人，当即带着家丁亲卫骑马冲出营地，向抚州方向逃去；左梦庚这一逃，左军主营立刻失去了最后秩序，大量左军疯狂的向营后逃去，剩下的则打出白旗向已经逼近营门的京营官兵乞降。
周围分营中的左军将校官弁士卒们注意到了左军主营的动静，原本也人心惶惶的他们立刻效仿着打出了白旗，之前同样带着督战队阻止部下逃亡的王允成等总兵见状知道大势已去，所以也不多话，也效仿左梦庚，直接带着身边的骑兵跑了。
这些左部总兵官一跑，接下来副、参、游、中军、都司等左部各级指挥官没有了约束，自然也一哄而散，其中个别有想法的副、参、游还试图多带了一些步卒逃跑，但更多的左部士兵却不愿意再追随这些将领了，所以，无计可施的这些左军将官，要么带着少量兵马仓皇南逃，要么就只能在部下的裹挟下向京营跪地乞降。
至于有没有人慌慌张张的向湖口方面逃跑的呢？
有，但这些人能逃到湖口的很少，大部分都被京营辅助骑兵给截杀在半途中了。
对于左军的崩溃，严德桓、许昇焘等人都十分的莫名，但这并不影响京营果断的发起全面追击；于是经过简短的会商，严德桓便亲自指挥府军营正军师及从湖口方面调回的10个骑马夜不收队、4个辅助骑兵团南下追击左部残兵，许昇焘则带着腾骧营正军师和金吾营正军师及10个夜不收队开向湖口，对湖口之敌实施警戒，柳宜昭带着府军营辅军师第三旅及全部重甲兵看管俘虏，府军营辅军师其余两个旅则负责从腾骧营正军师和金吾营正军师手中接收俘虏并押送俘虏至柳宜昭处看管。
京营这边一追就追到了，当天的日暮时分，最后统计战果的时候，才发现，当日，也就是明弘光元年四月十二日这一天，京营一共击杀左军937人、受降12101人、俘虏13392人，战果比前一天芳湖大战时还要辉煌许多。
对于2天里，左梦庚断送六万大军的事实，留守湖口（及刚刚从九江退到湖口）的左部陆师四总兵李伯平、丘越、于永绶、唐寿年----后两人，刚刚从九江撤来----左部水师总兵王崇寓等，及吕大器、左光先、黄澍等人一开始是不信的。
但十二日一早，京营骑兵就已经成群结队的出现在湖口附近，稍后骑兵虽然撤了，却换上了更多的步兵，这就让李伯平等人不得不相信，左梦庚部是吃了败仗。
只是，他们还幻想一时的败仗并不影响最终的战局，直到朱由崧派遣不同隶属的多名被俘左军副、参进入湖口城劝降，这才让几人彻底失去了希望。
吕大器等人知道，武将凭着手中的兵马，或许还能得到赦免，但自己等人作为失败的文臣，已经注定要钉死在耻辱柱上，所以基于成王败寇的惯例，无法回头的他们，便鼓动李、丘等将率兵北渡长江，到江北去继续折腾“清君侧”事宜。
然而李伯平等人商量之后，决定跟朝廷讨价还价----是的，李伯平等人又不傻，京营能干净利落的收拾了左梦庚部6万多人，自己这边才2万不到的陆师，又如何是京营的对手呢，就算想要北逃，那也得问问朝廷水师答不答应，京营会不会坐视了。
于是，李伯平等人秘密派遣使者出城，试图与朱由崧谈判，对此，胜券在握的朱由崧断然予以拒绝，并命令随军西厂提督万世告知对方，明日一早不开城投降的话，京营便发起进攻，彻底消灭湖口周边的左部残军。
虽然，朱由崧的强硬让李伯平等人十分不满，但形势比人强，所以，枯坐了一夜之后，李伯平等人还是答应于四月十三日一早，开城向京营投降······
“皇爷，点检发现湖口左军陆师共有一万七千八百二十三员，水师一万九千零十四员；此外，还有水师伤兵三千零十九员，百姓三十九万二千零五百三十三人；物资方面，大小舟